Pada tahun 1979 atas prakarsa Bapak Drs. Ida Bagus Netera (almarhum) saat itu merupakan dosen IKIP Singaraja (saat ini Undiksha) mendesak pengurus Yayasan Dana Punia untuk mendirikan Perguruan Tinggi Hindu, berdasarkan masukan tersebut dan setelah diadakan diskusi-diskusi antar pengurus Yayasan, maka pada tanggal 10 agustus 1979 didirikanlah Perguruan Tinggi Hindu dengan Program Studi Pendidikan Agama Hindu (Diploma 3) yang bernama Akademi Pendidikan Guru Agama Hindu (APGAH) Singaraja yang diketuai oleh Bapak Ida Bagus Indugosa, S.H.

Pada tanggal 22 Oktober 1985 APGAH Singaraja berubah bentuk menjadi Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan Agama Hindu Singaraja (selanjutnya disebut STKIP Agama Hindu Singaraja) dengan satu program studi yaitu Program Studi Pendidikan Agama Hindu (Strata I).

Dalam perkembangannya hingga saat ini STKIP Agama Hindu Singaraja memiliki 4 program studi, yaitu:

  1. Program Studi Pendidikan Agama Hindu (Strata I) terdaftar pada tanggal 22 Oktober 1985;
  2. Program Studi Pendidikan Olahraga dan Kesehatan (Strata I) terdaftar pada tanggal 7 Januari 1988;
  3. Program Studi Pendidikan Bahasa Inggris (Strata I) terdaftar pada tanggal 23 Juni 1999; dan
  4. Program Studi Ilmu Komunikasi Hindu (Strata I) memperoleh izin penyelenggaraan pada tanggal 22 Desember 2011

Penyelenggaraan pendidikan di Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan Agama Hindu Singaraja (STKIP) berpedoman pada Undang-undang Nomor 20 Tahun 2003 tentang sistem pendidikan nasional, Undang-Undang Nomor 12 Tahun 2012 tentang Pendidikan Tinggi dan peraturan perundang-undangan yang berlaku.

STKIP Agama Hindu Singaraja Menyelenggarakan Pendidikan, Penelitian, dan Pengabdian Kepada Masyarakat untuk melahirkan sumber daya manusia yang memiliki kemampuan akademik dan profesional yang bermutu tinggi untuk memenuhi kebutuhan masyarakat.